泵站结构设计为矩形二孔钢筋混凝土沉井结构，沉井四周外围打2排φ500水泥搅拌桩做止水帷幕，基础为φ500深层搅拌桩复合地基。
沉井外边尺寸为13.3m×11.3m，外墙厚0.9m、隔墙厚0.6m，内孔尺寸分别为9.5m×5.6m 、9.5m×5.3m，沉井顶高程为10.20m（±0.000），沉井刃脚底高程为-4.10m，沉井结构总高14.3m。外地面高程为7.0m，实际下沉深度为11.1m